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研究称新型超毒性大肠杆菌导致德国疫情大爆发--国家史册
华大基因[JiYin]研究院表示，德国大肠杆菌[DaChangGanJun]疫情暴发之后，该研究院成立专门研究小组对该细菌进行测序和生物信息学分析，以便尽快寻找到致病机理。在获得病毒样本后三天的时间内，华大基因[JiYin]完成了对该新型大肠杆菌[DaChangGanJun]的基因[JiYin]组测序。经过初步信息分析，发现该菌株是一种新的兼具侵袭、产毒、肠出血等特征的大肠杆菌[DaChangGanJun]。
华大基因[JiYin]利用第三代测序仪进行了该大肠杆菌[DaChangGanJun]的全基因[JiYin]组测序。通过对序列的分析发现，该菌株属于血清型O104，但O104型大肠杆菌[DaChangGanJun]以前未见引起人类感染大规模暴发的报道。通过进一步比对分析发现，该菌株与2002年从中非艾滋病患者腹泻标本中分离的肠侵袭性大肠杆菌[DaChangGanJun]55989菌株的同源性超过93%。根据对基因[JiYin]序列的分析结果显示，导致疫情暴发的菌株通过基因[JiYin]水平转移获得了肠出血性大肠杆菌[DaChangGanJun]的毒力基因[JiYin]和毒力相关质粒，可能与该菌株强毒性和重症感染有关。
研究还发现，该菌株携带氨基糖甙类、大环内酯类、磺胺类等抗生素的耐药基因[JiYin]，导致抗生素治疗无效。深圳华大基因[JiYin]研究院表示，该院正在和中国疾病预防与控制中心、中国军事医学科学院微生物流行病研究所合作，进一步分析这些毒力相关基因[JiYin]的完整性和表达情况、耐药和毒力基因[JiYin]水平转移机制，并在更多暴发菌株中进行验证。
据德国卫生部公布的数据，这场大肠杆菌[DaChangGanJun]疫情至今已导致17人丧生。连日来，肠出血性大肠杆菌[DaChangGanJun]也蔓延到其他不少欧洲国家和美国。据世界卫生组织公布的最新统计，除德国外，已有奥地利、丹麦、法国、荷兰、挪威、西班牙、瑞典、瑞士、英国和美国等国报告了肠出血性大肠杆菌[DaChangGanJun]感染病例或其严重并发症。