在功成名就后，王淦昌却突然从人们的视线中消失了。1961年4月1日，王淦昌接受了研制核武器的任务，从此他隐姓埋名，默默无闻地从事这项伟大事业，将他的后半生奉献给了国防工业，成为中国[ZhongGuo]核武器研究的开拓者。为中国[ZhongGuo]的“两弹”，王淦昌甘当无名英雄17年之久。

　　1960年，正当苏联的《真理报》和权威刊物《自然》杂志隆重庆祝中国[ZhongGuo]科学家取得成功时，一封来自北京的绝密电报传到研究所，通知王淦昌“放弃手中的工作[GongZuo]，马上回国受领新的任务”。

　　回国后，王淦昌被召进第二机械工业部部长刘杰的办公室，老朋友钱三强也在那里。刘杰和蔼地微笑着，开门见山地说：“毛主席和党中央已经作出决定，我们也要研制原子弹。已决定启动中国[ZhongGuo]原子弹工程，现在有人想卡我们，我们要争口气，造出自己[ZiJi]的争气弹！今天请您出山，就是要请您参与领导原子弹的研制工作[GongZuo]。”

　　“我们也要造原子弹了？！”听了刘杰的话，王淦昌心里好一阵激动，心头骤然升起民族自豪感和尊严感。他感谢刘杰的知人善任，也为自己[ZiJi]有了用武之地而跃跃欲试。

　　刘杰点了点头严肃地说：“主席特意将此命名为‘596工程’。总理将此列为国家的最高核心机密，交代要绝对保密，所有参加的人员都要隐姓埋名，跟海外也要断绝一切来往和关系，这些你能做到吗？”刘部长用殷切的目光等待回答。（1959年6月，苏联政府单方面撕毁了中苏双方签订的关于国防新技术的协定，拒绝向中国[ZhongGuo]提供原子弹样品和生产原子弹的技术资料。面对险恶的国际环境和严峻的经济形势，中共中央决定削减其他一些科研项目和常规武器的生产，集中一切力量把“两弹”研制出来，为了牢记1959年6月，中国[ZhongGuo]的原子弹研制项目被定名为“596”工程。）

　　王淦昌不假思索地作了一字千金的承诺：“没问题。坚决按组织的规定办。”