宋代书院在教育及教学管理方面，形成了自己的特色，其具体内容如下：

第一、书院的教育经费来源多样化。书院的经费，得到官府的资助，也依靠民间自己筹集，主要靠学田供给。以白鹿洞书院为例，在南宋先后三次由官府增置学田。第一次在淳熙七年(1180年)，始置学田870亩；第二次在淳熙十年(1183年)，置办700亩；第三次在嘉定十四年(1221年)，置办学田300亩。书院总共拥有学田1870亩。岳麓书院在绍熙五年(1194年)，官府一次就拨给学田50顷，书院学生日给米一升四合，钱六十文。

像浙东一代的富庶地区，则常有巨商赞助书院。东阳(今浙江金华)郭氏累代出资创办书院，家拨良田数百亩用于养士，其子孙后代先后设立了石洞书院、西园书院和南湖书院。浙东的杜州六先生书院，也是私人出资办学，设有先圣碑亭、礼殿、讲堂、生员六宅、慈湖祠、书库、门廊、庖 ，书院内部设施十分完善，办学条件也很优越。

第二，书院实行山长负责制，管理体制日趋完备。宋代书院的最高首脑称为山长、洞主或洞长。山长既是主要的教学者，又是最高的管理者，并且往往都由著名的学者来担任。北宋的书院除了山长之外，其他教学管理辅助人员的设置很少。南宋书院，随着办学规模的日益扩大和书院内部设施的日益增多，书院教学管理人员的设置也相应增加。以金陵的明道书院为例，除设山长一员总负教养之责外，斋舍六堂各设堂长一员，分司其职。此外还有讲书、堂录、堂宾、直学、讲宾、司计、掌书、掌祠、医谕和职事生员协助管理。教职人员的名目达十余种之多。

书院教职人员人数的扩大和分工管理制度的形成，标志着书院教育管理水平的提高，也是书院教学管理形式更加规范化、制度化的一个方面。

第三、书院实行开放式的教学和研究。求学者不受地域、学派的限制均可前来听讲、求教。例如朱熹的学生黄干在白鹿洞书院讲《易经》乾坤二卦，山南山北的人士都来听讲。白鹿洞书院后来还拨出一笔专款，用来接待四方来求学的人，并有专人负责招待。

教学人员也不限于书院自身，而是广泛邀请学界名流前来讲学，例如在张 主持岳麓书院的时候，就曾经邀请朱熹到书院讲学月余。讲学甚至包括不同学派的学者。南宋鹅湖书院 就曾同时邀请朱熹和陆九渊来讲学，二人观点对立，辩论相当激烈。朱熹在观点上坚持己见，但在治学态度上不排斥异己，他很欣赏陆九渊的《论语》研究，又将陆九渊请到自己主持的白鹿洞书院讲《论语》，还将他的讲义刊刻在石碑上，供书院长久学习。书院的门户开放风格，大大促进了学术交流和发展，也开阔了学生视野，深化了教学。