南宋初年，济南太守刘豫投降了金朝。当时北方的民众不满金人统治，时常举事反抗。金国朝廷有感于汉族人难以统治，就让刘豫表面称帝，自己躲在背后操纵。于是刘豫在金天会八年（1130年）于大名府（今河北大名）称“大齐皇帝”，史称“伪齐”。刘豫在其称帝期间（1130—1137），强令征集民工开挖河道[HeDao]，历时数年，凿通了小清河[QingHe]。
　　刘豫开凿小清河[QingHe]，是在历城县华山之南筑堰（名“下泺堰”），由此而向东北方向打通了一条与当时的“清河[QingHe]”平行的河道[HeDao]，使原来注入北清河[QingHe]的济南北郊湖泊之水，改向东流，经章丘、邹平、长山、新城、高苑等地，于博兴的马家渎注入渤海，全长500多华里。刘豫筑起“下泺堰”，其作用就是使泺水分流，堰以南新开河流称小清河[QingHe]，堰以北的北清河[QingHe]从此便改称大清河[QingHe]。
　　刘豫当时开凿小清河[QingHe]，是为了便于将广饶一带的海盐自小清河[QingHe]运至历城与南宋交易，增加财富，巩固自己的统治地位。小清河[QingHe]的开通，客观上讲其作用则远远不止这些，它对于改善山东东、北部的航运、灌溉、排涝条件，供给下游沿河各地居民优质饮用水，促进小清河[QingHe]流域经济、文化和社会的交流与发展，都起到了很重要的作用。
　　仅就地理意义上说，小清河[QingHe]的开通对山东特别是对鲁北也是十分必要的。据自汉朝至隋朝的书籍记载，鲁北的河流主要有3条：济水最南，黄河最北，泺水居中，并没有清河[QingHe]。“清河[QingHe]”名称的出现是在唐代。其实清河[QingHe]原本就是济水的改道，因为东汉后，黄河从河南的滑县改道东北，流经河北、山东两省入海，在河南境内济水就已经注入了黄河。而山东境内的菏泽、汶水等，仍循济水故道汇流入海。唐朝的人们为了区别于古时的济水，而将这段河流改称为清河[QingHe]。到了宋朝，清河[QingHe]又有了南北之分。北宋熙宁十年（1077年）黄河在澶州（今河南濮阳）决口，水流先南又东，会于梁山泊后分为两部分，一部分沿古泗水入淮河，另一部分自东阿至历城一段沿济水改道，出历城后流经济阳、齐东、青城等县，到蒲台以北顺着故黄河河道[HeDao]入海。小清河[QingHe]开通以前，济南以东、淄河以西，泰鲁山脉以北、黄河以南的这大片平原没有一条贯穿东西的河流，而这一带恰恰又是山水、泉水、湖泊众多的地区，经常受水灾之害。由于小清河[QingHe]的开通，使这一大片地区有了一条横贯东西的河流，增强了这里的排涝、抗旱能力，极大地便利了这片地区物资特别是食盐的运输，便利了沿河居民的交往。
　　小清河[QingHe]开通后，济南的众多泉水大都流入了这条河，而水量最大的是趵突泉，因此人们就往往把济南的趵突泉作为小清河[QingHe]的发源处。到了清朝末年，人们又在济南的睦里庄建起了一座水闸，玉符河水盛涨时就关闭闸门，使水北流进入黄河，水小的时候则开启闸门，使水东流进入小清河[QingHe]。
　　由于小清河[QingHe]所经之地，正是黄河经常决堤、泛滥、淤积的地区，因此，随着小清河[QingHe]的开通，小清河[QingHe]的治理[ZhiLi]也就随之开始了。
　　小清河[QingHe]河道[HeDao]开始是自历城、章丘、济阳，最后从博兴的马家渎入海。到金朝皇统九年（1149年），改道高苑县城南与时水（乌河）相会后入海。元朝又重新疏浚。但是元朝以前对小清河[QingHe]水患、疏浚和治理[ZhiLi]的情况，记载的史书典籍不多。从明朝开始后，这方面的记载才逐渐多了起来。明永乐元年（1403年），官府征集民众整修了章丘段漯河的东堤。永乐三年，又复修了历城段小清河[QingHe]的决堤。永乐九年，疏浚邹平段的百条沟河（今称长白沟）。成化九年（1473年），对小清河[QingHe]进行了全线治理[ZhiLi]。这次治理[ZhiLi]全程疏浚了刘豫时期的故道，沿途又设置了多处闸所，并开凿了支脉沟，雨季水大就开闸放水分流，遇上干旱则关闭闸门蓄水保流。成化十一年，又针对小清河[QingHe]河道[HeDao]淤积、水陆转运耗时费力、雨季沿河两岸多遭淹没的问题，根据地形高低，从历城到乐安共疏浚了502里，使水行故道退出了农田。随后，又在河道[HeDao]以内，置设了38处潴水闸和减水闸用以防溢、备浅，闸旁还凿开月河，从而使小清河[QingHe]的航运、灌溉、排洪都得到了很大的改善。
　　后来，小清河[QingHe]河道[HeDao]又逐渐淤塞，雨季河水暴涨殃及两岸。嘉靖十二年（1533年）又召集民众重新疏浚小清河[QingHe]，自历城至博兴开挖疏通河道[HeDao]300余里。接着又疏浚了郑潢沟和新河，使玉、漯、孝妇诸河的河水又都重新流入了小清河[QingHe]。嘉靖二十三年，又一次整理小清河[QingHe]，从章丘到博兴225里。在博兴、乐安两县，沿小清河[QingHe]增筑堤岸180余里。
　　清康熙二十五年（1686年），小清河[QingHe]又一次大规模疏浚。经过这次治理[ZhiLi]，小清河[QingHe]从章丘经邹平到长山的陶唐口一段，实现了复航。然而由于下游的新城地势低洼，水流不畅，遇有大雨清沙泊便泛滥横流，沿泊的村庄悉数被淹。因此，民众又于康熙三十三年，在清沙泊的南岸，拥筑水堤18里，缓解了水患。康熙五十七年，再次兴工开通了支脉沟，该沟从高苑的军张口起，经博兴、乐安两县，会合小清河[QingHe]同注于海。这年的七月天降大雨，孝妇、大清诸河河水横溢，但小清河[QingHe]未造成大的水患。五十八年又在小清河[QingHe]的南面复开预备河，该河起麻大湖，穿会城泊东流，迤逦由乐安入海。这样，经过疏浚后的小清河[QingHe]作为中条，南条为预备河，北条为支脉沟。同时，又在军张口建起了石闸，每当遇上淫雨大水，便于浒山泊和清沙泊暂为停蓄，再流入支脉沟。然而时间不长，小清河[QingHe]从军张闸到博兴县界46里长的一段，又被淤塞。博兴民众便在傅家桥东筑起土坝。这样，小清河[QingHe]首尾就被分为两节，上节容纳章丘、邹平、长山、新城四县之水，汇为清沙泊，由军张口进入支脉沟。下节则会合汉溱、乌河、麻大湖、会城泊等诸水，至博兴的湾头庄进入小清河[QingHe]旧河后，又经过乐安县的新桥与支脉沟合流入海。中间的一段有40余里，便形成为乾河。
　　乾隆四年（1739年），再次治理[ZhiLi]小清河[QingHe]。首先将军张闸改为滚水坝，坝的顶端比其南边桑公堤还低两尺，这样便使蓄存于浒山泊和清沙泊内的水能够从滚水坝向下畅流，避免了泊内之水逆流成灾。这样，水流出泊后全都流入了支脉沟。乾隆六年，再次开浚支脉沟。后来由于支脉沟与预备河又逐渐淤塞，以致诸水散漫东流，到三十五年，又对支脉沟和预备河加以疏浚，并将乐安境内的小清河[QingHe]清淤、培堤。三十七年又大规模征召了13个县的民力，对博兴傅家桥以东的支脉沟加以展宽，使河道[HeDao]面宽6丈，深达7尺；为畅其尾闾，近海的地方，河道[HeDao]更宽更深。对于浒山泊和清沙泊，则仿照大运河捞浅的办法，除水草，去淤泥，做到面宽水深便于停蓄。另外，章丘境内的小清河[QingHe]，由于是由万丈口引入浒山泊，直接流入河口，这就使得小清河[QingHe]本身淤积日久。为解决这个问题，当时还在万丈口，就将正河引河并修，使水分流。经过清淤、固堤、裁弯取直的治理[ZhiLi]后，小清河[QingHe]水便依序由河入泊，由泊入沟，由沟入海。小清河[QingHe]的面貌有了很大的变化。
　　咸丰五年，黄河北徙，夺大清河[QingHe]入海。以前能够流入大清河[QingHe]的水，因受黄堤阻挡四处漫溢，小清河[QingHe]很快被淤垫。这一来历城的巨野河，章丘齐东交界的绣江河，都是水漫两岸，几成泽国。下游的邹平、长山、新城、高苑、博兴、乐安诸县，也都遭受了水灾。这时候，清朝官员正全力以赴对付太平天国农民起义，顾不上对黄河决口填堵，当然也就更谈不上治理[ZhiLi]小清河[QingHe]了。

　　小清河[QingHe]在光绪年间加大了治理[ZhiLi]力度。光绪九年，用银12万两，并采用调用民力、酌给津贴等办法，治理[ZhiLi]小清河[QingHe]。下游的水，如孝妇河、乌河、汉溱等，先经过锦秋、麻大、石村三湖，分别流入小清河[QingHe]故道及预备河（在广饶名福民河），再由刘王庄到八面镬，汇淄河入海，这段河面称为南股。上游的水，从历城县华山之南，引泺水、巨野河，经鸭旺口史公闸，向东汇绣江河，再在绣江河的新开口以南，汇獭河、黛溪、猪龙、沙河等水，由陶唐口、樊家林等处，透过高堤（村名）埝，流进支脉沟，再由支脉沟的下游马家楼汇淄河入海，这段称为北股。这样南北两股都是汇淄河入海。这次治理[ZhiLi]共整修河道[HeDao]480余里。
　　但没过几年，黄河南岸又遭决口，小清河[QingHe]再次淤积，沿河两岸又遭水患。光绪十七、十八两年，再一次治理[ZhiLi]小清河[QingHe]。这次治理[ZhiLi]主要是开挖了现存的小清河[QingHe]河道[HeDao]207里，使海口至省城300余里，可直接通达，使小清河[QingHe]成为了鲁北、鲁东分泄山泉诸水的一大干河。又将支脉沟上截，裁弯取直，展宽筑堤，以利于将上游历城、章丘等县的水流，汇总后灌入龙注洼。又在龙注洼下口，开浚正河110余里，使小清河[QingHe]的水径达寿光县羊角沟海口。整个河道[HeDao]深1丈有余，河面连马道宽达30丈。又利用挖出的土石在河两岸筑成大堤。十八年，继续治理[ZhiLi]小清河[QingHe]，又由金家桥向西取直，在支脉沟与预备河两河河套内，选择低洼区新开正河；正河经过博兴、高苑、新城、长山、邹平五县，至齐东县的曹家坡止，长近100里，河面连马道宽30丈，河床1丈。还从金家桥以下沿预备河旧址，新开浚支河到柳桥，通过这条新开挖的长24里的支河，将麻大湖上游的水引入了正河。随后又将历城、章丘、齐东三县境内的河段，依次深挖连通，这样，小清河[QingHe]恢复了全线航运，船只可以从历城的黄台桥直达羊角沟海口。
　　经过光绪十七、十八这两年的治理[ZhiLi]，小清河[QingHe]基本定型，具有了现在黄台桥与羊角沟间的规模。这两年开浚的正河约207里，为别于过去的小清河[QingHe]沿河各县河道[HeDao]称为新小清河[QingHe]。小清河[QingHe]的这次大规模治理[ZhiLi]取得了很大成效。一是使济南、青州两府所属沿河各县屡屡遭受的横溢之患得以解除；二是使沿河一带被淹洼地涸出了农田千百顷；三是将孝妇、汉溱、乌河三河之水，凡是小清河[QingHe]接受不了的，一并纳入了乾河入海；四是使淄河浑水得此大支清水灌刷，从而降低了河床，减缓了海口淤垫，减少了风险；五是使民间粮食、商贾货物，由海口到省城，一水可达，便利了航运；六是增加了支流，浚疏了河流，使黄河以南、泰鲁山脉以北的诸多山水能够随来随泄，有效解决了这片地区的洪涝灾害。